10 R Markdown

制作中

10.1 R Markdownの基本

クックブックook/

10.2 Chunk Option

各Chunkごとに各種設定が行える
参考文献1 参考文献2

マイナーだが便利なオプション

• cache
• fig.width
• fig.height

10.2.1 Global Option

Rmdファイル全体に適用したいoptionは、Global Optionとして設定できる。

opts_chunk$set(prompt = TRUE, message = FALSE)

10.3 Rmdでのディレクトリ設定

Rmdではsetwdをしてもチャンク毎にリセットされる。
ファイルでディレクトリを設定したい場合は、以下のように設定する。

opts_chunk$set(root.dir = "/path/to/folder/")

10.4 knitの出力先指定

knit: (function(...) rmarkdown::render(..., output_file = "./result.html", envir=.GlobalEnv))